Sandimmun anvendes først og fremmest til at forebygge afstødning af transplanterede organer (eksempelvis lunger). Endvidere anvendes stoffet også i enkelte tilfælde ved svær astma og lungefibrose.
Før behandlingen med Sandimmun kan påbegyndes, skal du have foretaget en bestemmelse af nyrefunktionen. Dette finder sted på Nuklearmedicinsk Afdeling.