Filgotinib bruges til behandling af tarmsygdommen colitis ulcerosa. Præparatet bruges ofte til patienter, der ikke længere har effekt af eller ikke tåler standardbehandling med andre biologiske præparater som Infliximab, Ustekinumab, Golimumab, Vedolizumab, Upadacitinib og Tofacitinib.
Filgotinib tilhører gruppen af såkaldte JAK-hæmmere, der hæmmer nogle af de signalstoffer (JAK-enzymer) i immunsystemet, som er med til udvikle sygdommen.
Medicinen tages som tabletter.