Via blodåren i armen føres et tyndt plastikrør (kateter) op til hjertet. Der indsprøjtes små mængder røntgen-kontraststof gennem kateteret og der optages røntgenfilm af hjertets kranspulsårer. På den måde kan lægen lokalisere de små grene af kranspulsåren, som forsyner det fortykkede område af hjertemusklen med blod.
Lægen undersøger med ultralyd, om kontrasten rammer det rigtige sted ved fortykkelsen af hjertemusklen. Når dette bekræftes, indprøjtes 2-3 ml ren alkohol.
Eftersom alkohol er giftigt for vævet, vil en del af den fortykkede hjertemuskulatur blive ødelagt. Dette resulterer i, at blodet lettere kan pumpes ud i kroppen.